企业的个人股东向公司转让专利,需要缴纳以下税款：
一、增值税：按“销售无形资产”计征增值税。
二、附加税费：以缴纳的增值税计征城市建设维护税、教育费附加、地方教育附加。
三、印花税：按“产权转移书据”缴纳印花税。
四、个人所得税：按“特许权使用费所得”计征个人所得税。
依据：
中华人民共和国增值税暂行条例
国家税务总局关于城市维护建设税征收问题的通知
中华人民共和国印花税法
中华人民共和国个人所得税法
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