企业以科技成果投资入股可以享受增值税优惠有根据《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》财税〔2016〕36号，技术转让、技术开发免征增值税。
企业以科技成果投资入股可以享受企业所得税的优惠文件有两个：
1、《财政部国家税务总局关于完善股权激励和技术入股有关所得税政策的通知》（财税（2016）101号）
2、《国家税务总局关于股权激励和技术入股所得税征管问题的公告》（国家税务总局公告2016年第62号）
依据：
财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知
关于完善股权激励和技术入股有关所得税政策的通知
国家税务总局关于股权激励和技术入股所得税征管问题的公告
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