企业改制，将之前的房产、土地按评估增值后的价值入账，评估增值部分不涉及土地使用税。土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据。 土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。前款土地占用面积的组织测量工作，由省、自治区、直辖市人民政府根据实际情况确定。根据上述规定，企业将之前房产、土地按评估增值后的价值入账，不影响土地使用税的计税依据，土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据。
依据：
中华人民共和国城镇土地使用税暂行条例
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