总机构应当在开具增值税专用发票(含货物运输业增值税专用发票)的次月申报期结束前向主管税务机关报税。 总机构及其分支机构取得的增值税扣税凭证，应当按照有关规定到主管税务机关办理认证或者申请稽核比对。
总机构汇总的进项税额，应当在季度终了后的第一个申报期内申报抵扣。
依据：
国家税务总局关于发布《航空运输企业增值税征收管理暂行办法》的公告
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