每年的第一个纳税申报期结束后，对上一年度总分机构汇总纳税情况进行清算。总机构和分支机构年度清算应交增值税，按照各自销售收入占比和总机构汇总的上一年度应交增值税税额计算。
分支机构预缴的增值税超过其年度清算应交增值税的，通过暂停以后纳税申报期预缴增值税的方式予以解决。分支机构预缴的增值税小于其年度清算应交增值税的，差额部分在以后纳税申报期由分支机构在预缴增值税时一并就地补缴入库。
依据：
财政部 国家税务总局关于重新印发《总分机构试点纳税人增值税计算缴纳暂行办法》的通知
- 分包方可以按3%简易征收吗？
- 一般纳税人提供建筑服务适用简易计税的增值税征收率是多少？
- 什么情况下可以开具3%的建筑服务发票？
- 老项目的建筑服务可以开三个点的增值税专用发票吗？
- 建筑劳务公司作为一般纳税人申请简易征收需要提供建筑劳务资质吗？
- 一般纳税人提供工程服务的增值税税率是多少？
- 旅游服务都包含什么？
- 提供会展服务可以差额征税吗？
- 出租房屋向承租方收取水费,增值税可以简易征收吗？
- 房屋租赁收取的空调费按售电开具发票吗？
- 小规模纳税人转售电的增值税税率是多少？
- 转登记小规模纳税人销售其取得的不动产，可以自行开具增值税专用发票吗？
- 小规模纳税人变更为一般纳税人之后，小规模纳税人期间的业务怎么开具发票？
- 小规模纳税人的房开企业销售房子，发票怎么开具？
- 购货方目前为小规模纳税人，要求他们变更为一般纳税人再开具发票，合理吗？
- 转登记纳税人在一般纳税人期间发生的应税行为，未开票需要补票的，按照什么税率开票呢？或者需要开具红字发票的，开票有误需要重新开具的，如何处理呢？
- 一般纳税人的房开企业销售房子，发票怎么开具？
- 小规模纳税人转让其取得的不动产，不能自行开具增值税发票的，可以向税务机关申请代开吗？
- 公司以前是小规模纳税人购进了一辆车，现在转为一般纳税人了将其出售可以开专用发票吗？
- 农村电网维护费由其他单位收取之后可以开具专用发票吗？
- 股票终止上市是什么意思?
- 上市公司主动退市制度是什么意思?
- 主动退市的情形都有哪些?
- 上市公司主动申请退市或者转市的程序是什么?
- 通过要约收购实施的退市和通过合并、解散实施的退市的程序是什么?
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